C'est en cherchant sur les excellents forums de Gentoo que j'ai finalement trouvé un indice qui m'a mené sur la bonne piste. Il existe un package masqué nommé udept qui permet de faire le grand ménage des packages installés sur une machine en enlevant tous ceux qui ne sont pas utilisés. Il peut aussi faire le ménage du world file.
J'ai aussi installé un package qui permet de retourner dans le temps si une installation brise qqc. Ce package s'appelle demerge.
Une fois ces deux packages installés, l'incatation magique fut:
demerge --record
dep -sa
demerge --record
dep -wa
demerge --record
emerge -avN world
demerge --record
emerge -e world
demerge --record
Ça m'a permit de nettoyer mon world file puis de tout ré-installer de zéro sans les packages qui ne sont plus utiles/utilisés.
Voila!
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